Конечно. Но если это не так, то администраторы кластера не устраивают опросы на форумах.   

А что именно рассказывать? Сейчас большая часть суперкомпьютеров это архитектурно обычные Linux-кластера, с установленными библиотеками для разработки ПО для систем с распределенной памятью. На практике это одна из реализаций стандарта MPI.
А большая проблема заключается в аппаратуре, а именно в создании эффективного интерконнекта между узлами. Скорость света уже давно одно из самых значительных ограничений роста эффективности больших вычислительных систем. Правда решения этой проблемы не обязательно аппаратное. Это могут быть и алгоритмы менее чувствительные к большим задержкам при передаче данных и протоколы передачи данных, эффективно работающие в условиях больших скоростей и Latency и т.д.

Дальнейший диалог будет намного эффективнее после определения целей и задач для проектируемого суперкомпьютера. Ну а дальше в зависимости от требований могут быть либо сборки на основе обычных Blade-серверов с InfiniBand до покупки суперкомпьютеров под ключ у IBM или Cray или Т-платформ и т.д.

А на счет Windows HPC, то как уже выше правильно сказали, ее имеет смысл использовать только если построение системы полностью оплачивается Microsoft.

Вот тут есть полезные материалы по лицензированию Windows HPC Server: http://www.microsoft.com/hpc/en/us/product...uting-faqs.aspx
Там написано, что HPC-кластер можно собрать не только на редакции Windows HPC Edition:

1) Q.  What operating systems does the Microsoft HPC Pack 2008 R2 support?
A.  
The head node must run any of the following x64-bit (Non-Itanium) operating systems:
Windows Server 2008 R2 HPC Edition
Windows Server 2008 R2 Standard
Windows Server 2008 R2 Enterprise
Windows Server 2008 R2 Datacenter

2) Q.  Does HPC Pack 2008 R2 require Windows Server 2008 R2 Enterprise?
A.  
Windows Server 2008 R2 Enterprise is only required when using two head nodes or two or more broker nodes in a failover configuration. Compute nodes can still run Windows Server 2008 R2 HPC Edition even when head nodes are using Windows Server 2008 R2 Enterprise.

3) Q.  Can my cluster contain both HPC Pack 2008 R2 Express and HPC Pack 2008 R2 Enterprise nodes?
A.  
Yes. Compute nodes that require the Enterprise functionality require a license per server for Microsoft HPC Pack 2008 R2 Enterprise. It is recommended when deployed in this mix licensed mode that the cluster administrator create a node group for Enterprise nodes to make job submission easier when using Enterprise-only features.


В связи с этим вопросы:
1) Из последнего вопроса не совсем ясно нужно ли закупать HPC Pack 2008 R2 Express/HPC Pack 2008 R2 Enterprise для ноды диспетчеризации (head node)?
2) Опять непонятна разница между HPC Pack 2008 R2 Express и HPC Pack 2008 R2 Enterprise?
3) Какие плюсы/минусы от использования Windows Server 2008 R2 HPC Edition по сравнению с другими редакциями?
4) Сейчас вроде как Windows Server 2008 R2 HPC Edition уже не продают, а предлагают вместо него Windows Server 2012 (http://www.microsoft.com/hpc/en/us/product...quirements.aspx). Кто собирался HPC Cluster 2012 отзовитесь? 

rhiannon, 
Скажите пожалуйста, для каких целей Вам нужен вычислительный кластер?

rhiannon, ты случаем не рекламой "мелкомягкой" продукции занимаешься?

В дополнение к уже заданным выше phprus и bsa встречным (и очень правильным) вопросам, я задам еще один: почему бы Вам не обратиться непосредственно в Microsoft? Вы собираетесь заплатить им деньги за продукцию, так что им эти деньги, в частности, в форме консультаций, и отрабатывать.